Stanice Kobylisy se nachází mezi Kobyliským náměstím a ulicí Pod Sídlištěm. Stanice má dva výstupy; východní, který je vyveden do povrchového vestibulu s dobrou návazností na tramvajovou i autobusovou dopravu, a západní, s podpovrchovým vestibulem pod Kobyliským náměstím.
Bezbariérový přístup do stanice je zajištěn osobním výtahem, který propojuje přímo úroveň nástupiště a ulice. Povrchový výtahový kiosek se nachází vně vestibulů v ulici Pod Sídlištěm. Od kiosku vede přes ulici ke Katastrálnímu úřadu upravený přechod se sníženými obrubníky.
V západním vestibulu je k dispozici další osobní výtah, který umožňuje přepravu pouze z uliční úrovně do vestibulu stanice bez možnosti přístupu na nástupiště metra. Povrchový výtahový kiosek se nachází u ústí ulice Nad Šutkou. V západním vestibulu je hygienické zázemí s upravenou kabinou a prodejní místo DP s předprodejem jízdenek (pult výška 94 cm).
Výtahové kiosky jsou propojené povrchovou trasou (cca 200 m) s upravenými přechody, která vede ulicí Pod Sídlištěm.
Kolejiště s nástupišti po obou stranách přiléhají ke společnému středovému prostoru. Nástupiště nejsou vybavena rampami pro usnadnění nástupu do vlaku. Vlakové soupravy na trase C jsou ale nízkopodlažní. Ve vestibulu se nachází stanoviště dopravní obsluhy a automaty na výdej jízdenek (otvor na mince výška 170 cm, dotykový displej výška max. 135 cm).
Osobní průchozí výtah (automaticky otevírané dveře šířka 90 cm; kabina šířka 110 cm, hloubka 160 cm) spojuje nástupiště a povrchový kiosek v ulici Pod Sídlištěm. Manipulační prostor před výtahem je dostatečný. Kabina je vybavena madlem a zrcadlem (výška 100 cm) na boční stěně a sklopným sedátkem v dosahu ovladače. Ovladač na nástupních místech je ve výšce max. 88 cm, maximální výška ovladačů uvnitř klece je 100 cm.
V západním vestibulu je umístěn další osobní výtah (automaticky otevírané dveře šířka 120 cm; kabina šířka 160 cm, hloubka 280 cm), který umožňuje přepravu pouze z povrchu do vestibulu stanice bez možnosti přístupu na nástupiště metra. Ovladač na nástupních místech je ve výšce max. 96 cm, maximální výška ovladačů uvnitř klece je 102 cm.
Hygienické zázemí se nachází v západním vestibulu, který je přístupný pouze z povrchu, a to výtahem z ulice Nad Šutkou (automaticky otevírané dveře šířka 120 cm; kabina šířka 160 cm, hloubka 280 cm).
Přístupná toaleta je součástí oddělení WC ženy. Vstupní dveře na toalety jsou jednokřídlé (šířka 96 cm) a otevírají se mechanicky ven. Následuje předsíň (šířka min. 186 cm, hloubka min. 192 cm).
Kabina (dveře šířka 80 cm; kabina šířka 165 cm, hloubka 170 cm) je uzamčená, klíče zajistí personál. Jednokřídlé dveře do WC jsou označené a otevírají se mechanicky směrem ven. Přístup k míse z pohledu od vstupu do kabiny je zleva. Prostor pro vozík vedle WC mísy je dostatečný (šířka 95 cm). Toaletní mísa je vybavena dvěma sklopnými madly.
Mapováno 5/2021